Née à Brno, en République tchèque, Magdalena Kožená a étudié le chant et le piano au conservatoire de Brno et avec Eva Bláhová à l'Académie des arts du spectacle de Bratislava. Lauréate de plusieurs grands prix en République tchèque et dans le monde, Magdalena Kožená s'est fait connaître grâce au sixième concours international Mozart de Salzbourg, qu'elle a remporté en 1995. En 1999, Magdalena Kožená a été prise sous contrat par Deutsche Grammophon en tant qu'artiste exclusive. En 2017, elle a entamé une relation à long terme avec le label classique néerlandais Pentatone. Tout au long de son illustre carrière, Magdalena Kožená a travaillé avec les plus grands chefs d'orchestre du monde, notamment Claudio Abbado, Pierre Boulez, Gustavo Dudamel, Sir John Eliot Gardiner, Bernard Haitink, Nikolaus Harnoncourt, Mariss Jansons, Sir Charles Mackerras et Sir Roger Norrington. Ses partenaires de concert sont les renommés pianistes Daniel Barenboim, Yefim Bronfman, Malcolm Martineau, András Schiff et Mitsuko Uchida, avec lesquels elle s'est produite dans des lieux aussi prestigieux que le Carnegie Hall, le Wigmore Hall, le Alice Tully Hall, le Concertgebouw d'Amsterdam et les festivals d'Aldeburgh, d'Édimbourg et de Salzbourg. Pour ses services rendus à la musique française, elle a été nommée Chevalier de l'Ordre des Arts et des Lettres par le gouvernement français en 2003.