Der in Sliema (Malta) geborene Brian Schembri begann seine musikalische Ausbildung bei seinem Vater, Carmelo Schembri und war mit 13 Jahren der jüngste maltesische Musiker, der an der Royal School of Music in London diplomiert wurde. Er setzte seine Studien an der Musikakademie Peter Tschaikowski in Kiew und am Moskauer Tschaikowski-Konservatorium unter Sergei Dorenski (Klavier) und Gennadi Roschdestwenski (Dirigieren) fort.

1989 wurde er zum Assistenten des Orchestre national du Capitole de Toulouse unter Michel Plasson und Emmanuel Krivine berufen, später wurde Brian Schembri zum musikalischen Leiter des Orchestre Philharmonique de Radio-France und 2003 des Orquestra Metropolitana de Lisboa ernannt.
Er dirigierte zahlreiche internationale Orchester, darunter das Orquesta Sinfònica de Barcelona, das Litauische Nationale Symphonieorchester, die Philharmonie von Nowosibirsk, das Königliche Symphonie-Orchester von Oman und das London Philharmonic Orchestra. Daneben leitete er zahlreiche Opernaufführung.

Neben seiner Tätigkeit als Musikalischer Direktor und Berater des Teatru Manoel, einen Posten, welcher er seit 2008 besetzt, wurde Schembri im Januar 2014 auch zum künstlerischen Leiter des Philharmonischen Orchesters von Malta ernannt.